一八九八年（明治三十一年、光緒二十四年）二月二十六日，第四任總督．兒玉源太郎及民政局長後藤新平正式就任。這位日本中將卻有政治頭腦，對抗日戰爭就是停止以武裝鎮壓，再來又以招撫政策，又發表比較寬大的「匪徒刑罰令」，原本犯此法是唯一死刑罪，但修正其中規定犯匪徒刑罰令者若自動向官府自首時，量情節減輕或全免其刑。並提供資金及工作。後藤利用投誠的「土匪」建造至今仍在使用的台北至宜蘭的峻急山區道路。
對台灣義民軍將採用「招降政策」，配以各種「軍事大掃蕩」的來進行作業。
台中縣的「大掃蕩」乃是十一月十二日開始、至二十三日終止。在這十二天之間，據總督府的統計： 被殺戮者二百二十八人、 被捕三百二十四人。所獲槍枝五十二枝。依常理判斷實際上當然是遠超過總督府所公佈的數字。